CRIOBE

BIOCODE
Barcoding des organismes vivants de Moorea – du sommet de la montagne aux récifs profonds

Dans le cadre d’un financement démonstratif de la Fondation américaine Gordon and Betty Moore, la station Gump de l’Université de Berkeley (Californie, USA) et le CRIOBE (CNRS-EPHE) ont été chargés d’étudier la faisabilité de bar-coder la totalité des organismes vivant de l’île de Moorea.

Ce projet est unique dans le sens où il est question d’intégrer la totalité des écosystèmes d’un système insulaire en partant du sommet de la montagne et ce jusqu’aux récifs profonds. Le projet Biocode fournira non seulement un système d’identification d’espèce, intégré pour la biologie de terrain et la conservation des espèces, mais aussi l’infrastructure d’informatique nécessaire pour associer l’écologie, la systématique et la génomique. La composante bio-informatique du projet est développée par des informaticiens associés au Berkeley Natural History Museum. Dans le cadre de la phase préliminaire, nous avons ciblé les poissons coralliens et les insectes. Concernant le CRIOBE, le travail s’est traduit par une mission substantielle pour la collecte de toutes les espèces de poissons qui a permis d’échantillonner plus de 500 espèces et 1500 individus qui ont été séquencés et intégrés dans une base de données compilant toutes les informations : http://bscit.berkeley.edu/biocode.

Un travail identique a été réalisé pour les insectes avec pour base opérationnelle la station GUMP. Finalement, le succès de cette phase préliminaire développée en 2006-2007 s’est traduit par une implication plus forte de la Fondation Gordon and Betty Moore qui finance à partir de 2008 la continuité du projet pour 3 ans supplémentaires.

Ce projet est un partenariat entre le CRIOBE, l’UMR 5244 (CNRS-EPHE-UPVD), l’Université de Berkeley, l’Université de Floride et la Smithsonian.