Camille CLERISSI

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Maître de Conférences
École Pratique des Hautes Études (EPHE)

CRIOBE - Perpignan
USR3278 CRIOBE EPHE-CNRS-UPVD
Bâtiment R-CBETM
58 Avenue Paul Alduy
66860 Perpignan CEDEX
France

Email:

Domaines de Recherche:

  • Microbiologie/Microbiology
  • Virologie/Virology
  • Ecologie/Ecology
  • Evolution/Evolution
  • Génomique/Genomic
  • Bioinformatique/Bioinformatic
  • Biostatistiques/Biostatistics
  • Analyses multivariées/Multivariate analyses

Sélection de Publications

  • Clerissi C, Touchon M, Capela D, Tang M, Cruveiller S, Genthon C, Lopez-Roques C, Parker MA, Moulin L, Masson-Boivin C, Rocha EPC. 2018. Parallels between experimental and natural evolution of legume symbionts. Nature Communications, doi:10.1038/s41467-018-04778-5.
  • De Lorgeril J, Lucasson A, Petton B, Toulza E, Montagnani C, Clerissi C, Vidal-Dupiol J, Chaparro C, Galinier R, Escoubas J-M, Haffner P, Degremont L, Charrière GM, Lafont M, Delort A, Vergnes A, Chiarello M, Faury, Rubio TP, Leroy M, Pérignon A, Régler D, Morga B, Alumno-Bruscia M, Boudry P, Le Roux F, Destoumieux-Garzόn D, Gueguen Y, Mitta G. 2018. Immune-suppression by OsHV-1 viral infection causes fatal bacteremia in Pacific oysters. Nature Communications, doi:10.1038/s41467-018-06659-3.
  • Clerissi C, Brunet S, Vidal-Dupiol J, Adjeroud M, Lepage P, Guillou L, Escoubas J-M, Toulza E. 2018. Protists within corals: the hidden diversity. 2018. Frontiers in Microbiology, doi:10.1038/s41467-018-04778-5.
  • Brener-Raffalli K, Clerissi C, Vidal-Dupiol J, Adjeroud M, Bonhomme F, Pratlong M, Aurelle D, Mitta G, Toulza E. 2018. Thermal regime and host clade, rather than geography, drive Symbiodinium and bacterial assemblages in the scleractinian coral Pocillopora damicornis sensu lato. Microbiome, 6: 39. doi:10.1186/s40168-018-0423-6.
  • Clerissi C, Desdevises Y, Romac S, Audic S, de Vargas C, Acinas SG, Casotti R, Poulain J, Wincker P, Hingamp P, Ogata H, Grimsley N. 2015. Deep sequencing of amplified Prasinovirus and host green algal genes from an Indian Ocean transect reveals interacting trophic dependencies and new genotypes. Environmental Microbiology Reports, 7 (6): 979-989. doi:10.1111/1758-2229.12345.
  • Clerissi C, Grimsley N, Subirana L, Maria E, Oriol L, Ogata H, Moreau H, Desdevises Y. 2014. Prasinovirus distribution in the Northwest Mediterranean Sea is affected by the environment and particularly by phosphate availability. Virology, doi:10.1016/j.virol.2014.07.016.
  • Clerissi C, Grimsley N, Ogata H, Hingamp P, Poulain J, Desdevises Y. 2014. Unveiling of the diversity of prasinoviruses (Phycodnaviridae) in marine samples by using high-throughput sequencing analyses of PCR-amplified DNA polymerase and Major Capsid Protein genes. Applied and Environmental Microbiology, 80(10): 3150-3160. doi:10.1128/Aem.00123-14.
  • Bellec L, Clerissi C, Edern R, Foulon E, Simon N, Grimsley N, Desdevises Y. 2014. Cophylogenetic interactions between marine viruses and eukaryotic picophytoplankton. BMC Evolutionary Biology, 14: 59. doi:10.1186/1471-2148-14-59.
  • Clerissi C, Desdevises Y, Grimsley N. 2012. Prasinoviruses of the marine green alga Ostreococcus tauri are mainly species-specific. Journal of Virology, 86 (8): 4611. doi:10.1128/JVI.07221-11.

Biographie

FR/ Mes activités de recherche s’articulent autour d’un objectif majeur qui est de mieux appréhender la réponse des organismes aux changements environnementaux. J’aborde principalement cette question par deux facettes : la première consiste à étudier l’influence de l’environnement sur la composition des communautés, alors que la seconde repose sur l’analyse de l’adaptation des organismes à de nouveaux environnements. Pour cela, j’utilise des méthodes de séquençage à haut-débit (génomique, transcriptomique, metabarcoding), et leurs outils bioinformatiques, statistiques et multivariés. Dans ce contexte, mes derniers travaux portent sur le microbiote de macro-organismes variés (coraux, huîtres, plantes, etc.).

EN/ Through my research activities, I am mostly trying to understand how organisms respond to environmental changes. To tackle this issue, I am using two strategies. First, I study the influence of environmental conditions on community compositions. Secondly, I investigate the adaptation of organisms to new environments. Particularly, I am using high-throughput technologies (genomic, transcriptomic, metabarcoding), and the related tools of bioinformatic, statistics, and multivariate approaches. In this context, my last works concern microbiota associated to various macroorganisms (corals, oysters, plants, etc.).

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